香港公司進行公證認證時，需要準備的資料主要包括：

公司注冊證書（Certificate of Incorporation）：證明公司已正式注冊成立。
商業登記證（Business Registration Certificate）：表明公司已進行商業登記。
公司章程（Memorandum and Articles of Association）：包含公司的經營范圍、股東權益等信息。
股東和董事信息：包括股東和董事的身份證明文件，如護照或身份證復印件。
法團成立表格（Form NNC1或NNC1A）：新成立公司需提交。
公司狀態良好證明、存續證明：證明公司在注冊處的記錄良好，目前處于正常營業狀態。
相關訴訟證據：如果涉及到訴訟案件，可能需要提供相關的訴訟證據，如合同、會議紀要、賬單等。
律師授權委托書：如果需要授權他人代表公司處理相關事務，則需提供律師授權委托書。
以上文件通常需要由具備中國委托公證人資格的香港律師進行公證，并且公證后的文件需要經過中國法律服務（香港）有限公司的審核、登記和加章轉遞，以便于在內地使用。