香港營業執照不能直接注冊國內商標。雖然香港公司有權并可以在中國申請商標，以保護其在中國的商業利益和品牌形象，但根據《中華人民共和國商標法》及其相關規定，香港公司在內地注冊商標需要按照一定的程序和要求進行，并且通常需要委托國內代理機構辦理。

香港公司在內地注冊商標的申請流程一般包括以下步驟：
準備申請材料：

香港公司的營業執照或商業登記證明文件。
公司法定代表人或合法授權人的身份證明。
商標圖樣。
商標代理機構的委托書（如果選擇委托代理機構辦理）。
提交申請： 香港公司可以委托國內商標代理機構向國家知識產權局提交商標注冊申請。代理機構會對申請材料進行審核，確保符合內地商標法規和申請要求。

審查階段：

形式審查：對申請材料的齊全性、規范性進行審查。
實質審查：對商標是否具有可注冊性進行審查，包括是否與在先商標相同或近似等。
公告期： 如果商標申請通過了形式審查和實質審查，將進入公告期，公告期為三個月。任何人均可對公告的商標提出異議。

領取商標注冊證： 如果沒有人提出異議或異議已解決，香港公司可以領取商標注冊證，完成商標準備工作。

注意事項：
商標查詢難度：由于香港和內地的商標法規存在差異，香港公司在內地注冊商標時需要對內地商標法規和相關規定進行深入了解，以便準確判斷所申請的商標是否具有可注冊性。
保護范圍：香港公司在內地注冊商標時，需要考慮商標的保護范圍。內地對于商標的保護范圍可能比香港更廣泛，包括但不限于商品和服務的分類、名稱、標識等。
代理費用：雖然代理機構可以幫助香港公司更好地完成商標注冊申請，但也會產生一定的代理費用。因此，在選擇代理機構時，應充分了解代理機構的信譽和服務水平，并在預算范圍內合理控制費用支出。
綜上所述，香港營業執照不能直接注冊國內商標，但香港公司可以通過委托國內代理機構按照規定的程序和要求在內地注冊商標。