深圳海關(guān)分一線海關(guān)和二線海關(guān)。一線海關(guān)指申報之后直接可以出境的海關(guān)。而二線海關(guān)指申報之后必須再通過一線海關(guān)再報關(guān)才能出口的海關(guān)。

深圳海關(guān)共有七個一線海關(guān)： 大鵬海關(guān)、蛇口海關(guān)、機場海關(guān)、文錦渡海關(guān)、皇崗海關(guān)、沙頭角海關(guān)、深圳灣海關(guān)。其中蛇口海關(guān)又包括以下幾個碼頭；SCT （SHEKOU）、 赤灣（CHIWAN）、媽灣 （MAWAN ）、東角頭（進口碼頭）、大鏟灣暫時也歸蛇口海關(guān)。

一線海關(guān)當(dāng)中又分為船運海關(guān)、空運海關(guān)和陸運海關(guān)。船運海關(guān)：大鵬海關(guān)和蛇口海關(guān)；空港海關(guān)：機場海關(guān)；中港拖車陸運海關(guān)：文錦渡海關(guān)、皇崗海關(guān)、沙頭角海關(guān) 、深圳灣海關(guān)。

二線海關(guān)如筍崗海關(guān)、福田保稅區(qū)海關(guān)等。鹽田的怡和倉、力又倉庫，保開倉庫，中天元物流倉庫，新興倉庫，中建投物流倉庫、嘉利倉、佐川倉、馬士基物流等倉庫直接向大鵬海關(guān)申報。湖北倉、梅園倉、金云達倉等海關(guān)監(jiān)管倉庫向筍崗海關(guān)申報。

深圳海關(guān)報關(guān)作業(yè)時間

常用海關(guān)為大鵬海關(guān)、蛇口海關(guān)、文錦渡海關(guān)、皇崗海關(guān)、深圳灣海關(guān)、筍崗海關(guān)、機場海關(guān)，以七個個海關(guān)為主。

1.各口岸海關(guān)的報關(guān)作業(yè)時間

大鵬海關(guān)、蛇口海關(guān)、筍崗海關(guān)的作業(yè)時間為：周一到周五朝九晚五，周六、周日安排人值班。平常的工作時間約9：30才開始，下午4：30左右已經(jīng)不接單了。周六周日更晚一些。鹽田和蛇口的貨柜可以24小時進出。筍崗倉的進出時間為上午8：00-到晚上5：00，收貨時間可以稍晚一些。

文錦渡海關(guān)的作業(yè)時間為：上午9：00-晚7：30，文錦渡的過境時間可以到晚上10：00。
皇崗海關(guān)的作業(yè)時間為： 上午9：30-晚9：00，皇崗的空車可以24小時過境。裝貨車也要在晚上10：00之前出關(guān)。

機場海關(guān)的作業(yè)時間為：周一到周五是上午9點到下午6點，一般是9:30到5:30的樣子，周六、周日上午9點到下午4:30，一般是9:30到下午4點。

2.各口岸通關(guān)時間。

大鵬海關(guān)、蛇口海關(guān)、筍崗海關(guān)及機場海關(guān)的通關(guān)時間約為半天，即正常情況之下半天可以報關(guān)出來，特殊情況下不應(yīng)該超過一天。如遇查柜，另加一天。也就是說正常情況下，報關(guān)應(yīng)預(yù)留兩天時間。另請注意：下雨天不查柜。文錦渡、皇崗口岸的通關(guān)時間約為1小時。

深圳海關(guān)周末可以清關(guān)