根據(jù)《內(nèi)地和香港特別行政區(qū)關(guān)于對所得避免雙重征稅和防止偷漏稅的安排》第十三條財產(chǎn)收益中第四條規(guī)定，轉(zhuǎn)讓一個公司股份取得的收益，而該公司的財產(chǎn)主要直接或者間接由位于一方的不動產(chǎn)所組成，可以在該一方征稅。

《內(nèi)地和香港特別行政區(qū)關(guān)于對所得避免雙重征稅和防止偷漏稅的安排第二議定書》規(guī)定，第四條《安排》第十三條第四款及議定書第二條提及的公司財產(chǎn)不少于百分之五十由位于一方的不動產(chǎn)所組成，按以下規(guī)定執(zhí)行：在股份持有人轉(zhuǎn)讓公司股份之前三年內(nèi)，該公司財產(chǎn)至少百分之五十曾經(jīng)為不動產(chǎn)。

第五條規(guī)定，取消《安排》第十三條第五款的規(guī)定，用下列規(guī)定代替：“五、除第四款外，一方居民轉(zhuǎn)讓其在另一方居民公司資本中的股份或其他權(quán)利取得的收益，如果該收益人在轉(zhuǎn)讓行為前的十二個月內(nèi)，曾經(jīng)直接或間接參與該公司至少百分之二十五的資本，可以在該另一方征稅。”

《國家稅務(wù)總局關(guān)于〈內(nèi)地和香港特別行政區(qū)關(guān)于對所得避免雙重征稅和防止偷漏稅的安排〉有關(guān)條文解釋和執(zhí)行問題的通知》（國稅函〔2007〕403號）第七條關(guān)于第十三條財產(chǎn)收益規(guī)定：

（一）轉(zhuǎn)讓主要財產(chǎn)為不動產(chǎn)所組成的公司股份取得的收益
第十三條第四款及議定書第二條，關(guān)于轉(zhuǎn)讓公司股份取得的收益，如該公司的財產(chǎn)主要由不動產(chǎn)所組成，則該不動產(chǎn)所在方擁有征稅權(quán)的規(guī)定中“主要”一詞，根據(jù)議定書的規(guī)定為50%以上。對該規(guī)定暫按該股份持有人持有公司股份期間公司賬面資產(chǎn)曾經(jīng)達(dá)到50%以上為不動產(chǎn)理解及執(zhí)行。

（二）轉(zhuǎn)讓其他公司股份取得的收益
第十三條第五款，關(guān)于轉(zhuǎn)讓公司股份取得的收益，該項股份又相當(dāng)于一方居民公司至少25%的股權(quán)時，可以在該一方征稅的規(guī)定，執(zhí)行時暫按以下原則掌握：即如香港居民曾經(jīng)擁有內(nèi)地公司25%以上的股份，當(dāng)其將該項股份全部或部分轉(zhuǎn)讓并取得收益時，內(nèi)地?fù)碛姓鞫悪?quán)。

（三）雖有上述規(guī)定，雙方可以通過磋商對“曾經(jīng)”另行商定具體時限。
《國家稅務(wù)總局關(guān)于執(zhí)行〈內(nèi)地和香港特別行政區(qū)關(guān)于對所得避免雙重征稅和防止偷漏稅的安排第二議定書〉有關(guān)問題的通知》（國稅函〔2008〕685號）規(guī)定：

二、關(guān)于公司財產(chǎn)主要由不動產(chǎn)所組成的判定問題

第二議定書第四條有關(guān)股份持有人轉(zhuǎn)讓公司股份行為前三年內(nèi)公司財產(chǎn)至少百分之五十曾經(jīng)為不動產(chǎn)的規(guī)定，換函第二條明確執(zhí)行時按納稅年度終了時的賬面數(shù)據(jù)進(jìn)行判定。

三、關(guān)于轉(zhuǎn)讓公司股份或其他權(quán)益的稅收處理問題

根據(jù)第二議定書第五條規(guī)定，執(zhí)行《安排》第十三條第五款規(guī)定時，凡香港居民轉(zhuǎn)讓其在內(nèi)地居民公司中的股份或其他權(quán)益取得的收益，如果該收益人在轉(zhuǎn)讓行為前的十二個月內(nèi)，曾經(jīng)直接或間接擁有上述內(nèi)地公司25%以上的股份，內(nèi)地有權(quán)按相關(guān)稅收法律法規(guī)的規(guī)定予以征稅。

根據(jù)上述規(guī)定，如果香港B公司為香港居民且為受益所有人的條件下，如果B公司轉(zhuǎn)讓C公司股權(quán)之前三年內(nèi)，C公司的財產(chǎn)至少百分之五十曾經(jīng)為不動產(chǎn)的，B公司轉(zhuǎn)讓所持C公司的股權(quán)取得收益仍應(yīng)在境內(nèi)繳納企業(yè)所得稅；如果B公司轉(zhuǎn)讓C公司股權(quán)之前三年內(nèi)，C公司的財產(chǎn)不是主要直接或間接由不動產(chǎn)構(gòu)成的，并且B公司轉(zhuǎn)讓C公司股權(quán)前的十二個月內(nèi)直接或間接持有C公司25%以下（不包括25%）股權(quán)的，B公司可享受稅收安排待遇，免予在境內(nèi)繳納企業(yè)所得稅。

如果香港B公司不屬于香港居民，以及屬于香港居民但不屬于受益所有人的，轉(zhuǎn)讓C公司股權(quán)應(yīng)在境內(nèi)繳納企業(yè)所得稅。

香港居民轉(zhuǎn)讓內(nèi)地公司股份或取得分紅時，需由所持有的內(nèi)地企業(yè)代扣代繳所得稅，一般是10%，但是由于和香港有稅收協(xié)議，申請享受協(xié)議待遇后可以享受5%的優(yōu)惠稅率，享受協(xié)議所需資料最好咨詢當(dāng)?shù)貒惥郑@個業(yè)務(wù)各地對資料要求不是很統(tǒng)一，反正要求資料很繁雜。股權(quán)轉(zhuǎn)讓時由被轉(zhuǎn)讓方也就是買家代扣代繳所得稅，如果是同一集團(tuán)企業(yè)內(nèi)部轉(zhuǎn)讓適用特殊性稅務(wù)處理的，去按照《國家稅務(wù)總局2013年72號公告》進(jìn)行申請。另外特別提醒在股權(quán)轉(zhuǎn)讓時轉(zhuǎn)讓價格務(wù)必要高于資產(chǎn)賬面價格，否則的話稅務(wù)局可能會對標(biāo)的企業(yè)的固定資產(chǎn)主要是土地進(jìn)行評估，或者要求你提供估值的計算方法進(jìn)行審核，無論是哪種方式對企業(yè)和稅務(wù)局雙方的辦事人員都是一種折磨。