臺灣企業(yè)在內(nèi)地的合法經(jīng)營活動中，如果有來源于中國境內(nèi)的所得，需要依法代扣代繳企業(yè)所得稅。具體如下：

判斷征稅對象：根據(jù)《企業(yè)所得稅法》及其實施條例，非居民企業(yè)在中國境內(nèi)未設(shè)立機構(gòu)、場所的，或者雖設(shè)立機構(gòu)、場所但取得的所得與其所設(shè)機構(gòu)、場所沒有實際聯(lián)系的，應(yīng)當(dāng)就其來源于中國境內(nèi)的所得繳納企業(yè)所得稅。
確定稅率：企業(yè)所得稅的基本稅率為25%。對于符合條件的高新技術(shù)企業(yè)和小型微利企業(yè)，可能適用優(yōu)惠稅率，分別為15%和10%、5%。
扣繳義務(wù)：如果臺灣企業(yè)在內(nèi)地沒有常設(shè)機構(gòu)，實行源泉扣繳，以支付人為扣繳義務(wù)人。稅款由扣繳義務(wù)人在每次支付或者到期應(yīng)支付時，從支付或者到期應(yīng)支付的款項中扣繳。
稅收協(xié)定：如果我國與臺灣地區(qū)簽署有稅收協(xié)定，企業(yè)可以選擇適用稅收協(xié)定的優(yōu)惠稅率。
實際操作：在實際操作中，臺灣企業(yè)應(yīng)當(dāng)咨詢專業(yè)的稅務(wù)顧問，確保遵守內(nèi)地的稅法規(guī)定，合理合法地進行稅務(wù)申報和繳納。
總之，臺灣企業(yè)在內(nèi)地的稅務(wù)處理需要遵循內(nèi)地的稅法規(guī)定，合理安排稅務(wù)事宜，以避免稅務(wù)風(fēng)險。